Résumé : Background: The control of malaria in pregnancy remains a large challenge in Burkina Faso, despite the adoption of control measures known to be effective. Known effective programs include individual measures, such as intermittent preventive treatment during pregnancy, and the use of long lasting insecticide nets and daily supplementation of ferrous sulphate (200 mg) along with folic acid. Besides these measures, health programs that aim at enhancing the well-being of the population and improve maternal and child health have emerged, including results-based financing (in 2014), a project promoting health in 130 communities (implemented in 2015), and free health care (implemented in 2016). This thesis attempts to assess the effects of health programs on the space–time patterns of malaria (morbidity and mortality) through routinely collected data in pregnancy and explore the various prediction approaches to address challenges in routine health data reporting. Methods: We utilized a substantial range of data and applied advanced quantitative approaches while considering the specific distribution of the data. Our thesis is based on the valorization (analyses) of malaria surveillance data (aggregated by space and time units) recorded in the health information system of Burkina Faso between 2011 and 2019. These analyses also integrate environmental remote sensing data, data from periodic surveys, and data from other sources. These data were coupled into a database. After performing appropriate descriptive analyses considering the complexity of the data design, we performed spatio-temporal Bayesian modeling to determine areas with high risk and assess the effect of health programs on the space–time patterns of malaria incidence among pregnant women at the community-level; to explore an approach to estimate health facility readiness from survey data designed to be regionally representative (and then quantify the effect of this readiness on severe-malaria cases and case fatality); and to explore the prediction approaches used to address challenges in routine health data reporting, thereby supporting a malaria early warning system. Results: Our results show spatial and temporal heterogeneity and indicate that the annual incidence of malaria increased between 2013 and 2018, while the mortality rate decreased significantly. Some communities with a high malaria burden experienced a reduction in their risk through the deployment of the health programs mentioned above. The risk of a pregnant woman dying from severe malaria was 2.5 times higher in districts with low operational capacity. Finally, our thesis proposed an approach to respond to crisis situations that would affect data collection and could be used to set the target or provide early warnings for epidemics or other notifications. Conclusion: Our thesis provides useful tools for disease surveillance in developing countries to help optimize the scarce resources in malaria high burden areas. The results of our thesis could be used by the Ministry of Health to strengthen the capacity of existing surveillance tools and to develop rational strategies and/or new tools for monitoring malaria cases and associated deaths in communities.
Contexte : La lutte contre le paludisme pendant la grossesse reste un grand défi au Burkina Faso, malgré l'adoption de mesures de contrôle dont l'efficacité est reconnue. Les programmes dont l'efficacité est reconnue comprennent des mesures individuelles, telles que le traitement préventif intermittent pendant la grossesse, l'utilisation de moustiquaires imprégnées d'insecticide de longue durée et la supplémentation quotidienne en sulfate ferreux (200 mg) ainsi qu'en acide folique. Outre ces mesures, des programmes de santé visant à accroître le bien-être de la population et à améliorer la santé maternelle et infantile ont vu le jour, notamment le financement basé sur les résultats (en 2014), le projet de promotion de la santé dans 130 communes (mis en œuvre en 2015) et la gratuité des soins de santé (mise en œuvre en 2016). Cette thèse tente d'évaluer les effets des programmes de santé sur les caractéristiques spatio-temporelles du paludisme (morbidité et mortalité) par le biais de données de routine collectées pendant la grossesse et d'explorer les différentes approches de prévision pour relever les défis de la rapportage systématique des données de santé. Méthodes : Nous avons utilisé un large éventail de données et appliqué des approches quantitatives avancées tout en tenant compte de la distribution spécifique des données. Notre thèse est basée sur la valorisation (analyses) des données de surveillance du paludisme (agrégées par unités spatiales et temporelles) enregistrées dans le système d'information sanitaire du Burkina Faso entre 2011 et 2019. Ces analyses intègrent également des données de télédétection environnementale, des données issues d'enquêtes périodiques et des données provenant d'autres sources. Ces données ont été couplées pour constituer une base de données. Après avoir effectué des analyses descriptives appropriées en tenant compte de la complexité de la conception des données, nous avons procédé à une modélisation bayésienne spatio-temporelle pour déterminer les zones à haut risque et évaluer l'effet des programmes de santé sur les tendances spatio-temporelles de l'incidence du paludisme chez les femmes enceintes au niveau communautaire ; pour explorer une approche permettant d'estimer la capacité opérationnelle des établissements de santé à partir de données d'enquête conçues pour être représentatives au niveau régional (et ensuite quantifier l'effet de cette capacité opérationnelle sur les cas de paludisme grave et la mortalité) ; et pour explorer les approches de prévision utilisées pour relever les défis relatifs au rapportaga systématique des données de santé, pouvant aussi servir à un système d'alerte précoce du paludisme. Résultats : Nos résultats montrent une hétérogénéité spatiale et temporelle et indiquent que l'incidence annuelle du paludisme a augmenté entre 2013 et 2018, tandis que le taux de mortalité a diminué de manière significative. Certaines communes où la charge du paludisme est élevée ont connu une réduction de leur risque grâce au déploiement des programmes de santé mentionnés ci-dessus. Le risque qu'une femme enceinte meure d'un paludisme grave était 2,5 fois plus élevé dans les districts ayant une faible capacité opérationnelle. Enfin, notre thèse a proposé une approche pour répondre aux situations de crise qui affecterait la collecte de données et pourrait être utilisée pour fixer l'objectif ou fournir des alertes précoces pour les épidémies ou autres notifications. Conclusion : Notre thèse fournit des outils utiles pour la surveillance des maladies dans les pays en développement afin de contribuer à optimiser les ressources limitées dans les zones à forte incidence de paludisme. Les résultats de notre thèse pourraient être utilisés par le ministère de la santé pour renforcer la capacité des outils de surveillance existants et pour développer des stratégies rationnelles et/ou de nouveaux outils de surveillance des cas de paludisme et des décès associés dans les communautés.