Measuring similarities between transcription factor binding sites.

Kielbasa, Szymon M; Gonze, Didier; Herzel, Hanspeter

doi:doi/10.1186/1471-2105-6-237

Recherche avancée | Historique de recherche Mon DI-fusion | À propos de DI-fusion | Contact |

Citer

Measuring similarities between transcription factor binding sites.

par Kielbasa, Szymon M ;Gonze, Didier

;Herzel, Hanspeter
Référence BMC bioinformatics, 6, page (237)
Publication Publié, 2005

Article révisé par les pairs

Résumé :

Collections of transcription factor binding profiles (Transfac, Jaspar) are essential to identify regulatory elements in DNA sequences. Subsets of highly similar profiles complicate large scale analysis of transcription factor binding sites.

Documents en relation

DI-fusion

Novel insights into Emx2 and Dmrta2 cooperation during cortex development and evidence for Dmrta2 function in choroid plexus
par Anirudhan, Jithu , Shen, Xueyi , Szemes, Tünde , Dieu, Marc , Azouz, Abdulkader , Conrard, Louise , Passon, Nicolas , Doumont, Gilles , Sitte, Maren , Achouri, Younes , Kricha, Sadia , Salinas, Gabriela , Goriely, Stanislas , Renard, Patricia , Bellefroid, Eric
Publication 2025-06-01
Salivary Th17-Associated Cytokines as Potential Biomarkers in Primary Sjögren’s Disease
par Florezi, Giovanna P , Barone, Felippe P , Pelissari, Cibele , Soyfoo, Muhammad Shahnawaz , Delporte, Christine , Lourenço, Silvia
Publication 2025-05-06
Genome editing of TXNIP in human pluripotent stem cells for the generation of hepatocyte-like cells and insulin-producing islet-like aggregates
par Traini, Leonardo , Negueruela Escudero, Javier , Elvira Jimenez, Bernat , St-Pierre-Wijckmans, Wadsen , Vandenbempt, Valerie , Buss, Carlos Eduardo , Li, Ao , Perez Chavez, Israel , Ribeiro-Costa, Francisco , Nunes, Mariana , Messens, Joris , Ezeriņa, Daria , Hay, David C , Bansal, Mayank , Gurzov, Esteban Nicolas
Publication 2025-05-04
The importance of physiological and disease contexts in capturing mRNA modifications
par Penning, Audrey , Fuks, François
Publication 2025-05-01
Workflow4Metabolomics (W4M): a user-friendly metabolomics platform for analysis of MS and NMR data
par Delporte, Cédric , Tremblay-Franco, Marie , Guitton, Y. , Canlet, Cecile CC , Weber, Ralf J. M. , Hecht, Helge , Price, Elliott James , Klanova, Jana , Joly, Charlotte , Dalle, Céline , Saint-Vanne, Julien , Thévenot, Etienne E.A. , Schmitz, Isabelle , Chéreau, Sylvain , Dechaumet, Sylvain , Diémé, Binta , Giacomoni, Franck FG , Le Corguillé, Gildas G C , Pétéra, Mélanie MP , Souard, Florence
Publication 2025-06-14

Référencement	Visibilité	Pérennité	Facilité
Les publications encodées constituent la bibliographie académique de l'Université.	Les documents déposés sont indexés par les moteurs de recherche (Google Scholar,…).	Les documents déposés en open-access sont archivés au sein du réseau de préservation SAFE-PLN (www.safepln.org).	Les listes de publications sont compatibles avec le CV-ULB, le FNRS et accessibles sur le web.