Mémoire
| Résumé : | Les R-bodies sont de grandes structures protéiques intracellulaires adoptant une forme en rouleau capable d’une expansion télescopique. Elles ont été décrites pour la première fois dans les années 1950 chez des bactéries du genre Caedibacter, symbiotes de paramécies. La production de R-bodies par ces bactéries permet à la paramécie hôte de tuer d'autres paramécies sensibles, jouant ainsi un rôle dans la compétition.Récemment, dans notre laboratoire, des structures semblables ont été identifiées chez Chryseobacterium nematophagum, une bactérie vivant librement, non symbiotique, phylogénétiquement éloignée de tous les exemples précédents. Cette découverte suggère que la capacité à produire des R-bodies pourrait conférer un avantage adaptatif. Des observations récentes en laboratoire suggèrent qu'il est lié à une protection contre la prédation phagocytaire ou à d’autres interactions antagonistes avec des protistes ou d’autres micro-organismes.De manière notable, la production de R-bodies semble restreinte à une faible fraction de la population cellulaire, ce qui suggère une régulation fine. Cela est probablement dû aux coûts métaboliques et physiologiques liés à la production de ces structures gigantesques.Dans cette étude, qui se veut une première étape vers la compréhension des mécanismes de régulation de production de ces structures chez Chryseobacterium nematophagum, nous avons d’abord caractérisé la proportion des cellules productrices de R-bodies au cours du temps. Nous avons observé une variation du taux de production allant de 1 à 2,5% de la population, avec un pic autour d’une densité optique (DO) de 1.Par ailleurs, nous avons démontré que le cluster de gènes codant pour les R-bodies est probablement transcrit sous la forme d’un ARNm polycistronique, grâce à l’identification du site d’initiation de la transcription et d’un seul promoteur actif.À l’aide d’approches bio-informatiques, nous avons également mis en évidence la présence de gènes codant pour régulateurs transcriptionnels hypothétiques situés en aval du cluster reb. Nos analyses montrent que ces gènes codent pour un système à deux composants (type histidine kinase et régulateur de réponse), dont la délétion abolit la production des R-bodies, soulignant leur rôle central dans l’activation transcriptionnelle du système. |
