Mémoire
| Résumé : | Le diméthylsulfoniopropionate (DMSP) est une molécule pouvant servir de source de carbone et de soufre pour les bactéries, et dont la particularité est de pouvoir être clivée par celles-ci dans une réaction produisant du diméthylsulfure (DMS), une molécule d’enjeux climatique. En effet, le DMS est un gaz qui peut être émis dans l’atmosphère et agir comme un noyau de condensation pour les nuages au sein de celui-ci, renforçant ainsi l’albédo à la surface de la terre et pouvant potentiellement et en partie contrer le réchauffement climatique. La consommation bactérienne du méthane (CH4) en tant que source de carbone a également été étudiée, cette consommation pouvant potentiellement réduire les émissions atmosphérique de ce gaz à effet de serre. Cependant, l’équipement enzymatique nécessaire pour cliver le DMSP en DMS et pour consommer le CH4 n’est propre qu’à un groupe restreint de bactéries, et le DMSP peut aussi être déméthylé sans production de DMS. Sur base de données de séquençage 16S, la diversité a été analysée dans le temps et dans l’espace pour tenter de mettre en évidence des groupes bactériens positivement liés à la production de DMSP par les colonies de Phaeocystis abondantes en mai dans la zone côtière Belge. Cette diversité a été décrite et le genre bactérien Sulfitobacter ayant clivé le DMSP dans d’autres études est significativement lié au DMSP et est particulièrement abondant lors des efflorescences printanières de Phaeocystis. De plus, trois autres genres bactériens sont significativement liés au DMSP mais seul des PCR pourront mettre en évidence dans des échantillons bactériens la présence d’enzymes conférant la capacité de consommer le DMSP. Ces PCR n’ont pas pu être réalisées dans le cadre de ce travail dû à la crise du COVID-19 mais les protocoles nécessaires à leur réalisation ultérieure ont été décrits. La relation des bactéries avec le CH4 a aussi été analysée, mais seuls deux genres de bactéries connues pour être méthanotrophes ont été identifiées et elles ne présentaient pas de lien significatif avec le méthane. |
