par Gerodez, Antoine 
Président du jury Vanhamme, Luc
Promoteur Van Lint, Carine
Co-Promoteur Barbezange, Cyril
Publication Non publié, 2025-12-19

Président du jury Vanhamme, Luc

Promoteur Van Lint, Carine

Co-Promoteur Barbezange, Cyril
Publication Non publié, 2025-12-19
Thèse de doctorat
| Résumé : | Influenza A viruses (IAVs) remain a major global health concern due to their seasonal burden and pandemic potential. Avian IAVs occasionally infect humans, potentially representing early steps toward the emergence of a pandemic IAV. The recent H5N1 clade 2.3.4.4b, linked to widespread outbreaks in birds and infections in mammals and humans, highlights the need to better understand viral adaptation and host susceptibility.As the first line of defense, the innate immune system plays a central role in infection outcomes. However, how innate immunity proteins detect, control, or are evaded by IAVs and how they shape species barriers remains unclear.This thesis used complementary in-depth and interactomic-based approaches to identify host factors modulating IAV replication across multiple innate immune pathways. The AP-1 transcription factor cFos was found to promote virus replication, potentially by inhibiting interferon-β, suppressing apoptosis, and supporting viral transcription. Comparative analyses revealed how innate immunity influences host range and could help assess the pandemic risk of avian IAVs, though current methodological limits constrain the predictive power of this approach.Overall, this work deepens our understanding of the interplay between IAV and the innate immune system, identifies host factors that warrant further study, and paves the way for improved tools to evaluate the pandemic potential of emerging avian IAVs. |
| Les virus Influenza A (IAVs) représentent une menace majeure pour la santé mondiale en raison de leur impact saisonnier et de leur potentiel pandémique. Les IAVs aviaires infectent parfois l’homme, ce qui peut constituer une étape vers l’émergence d’un virus pandémique. Le virus H5N1 clade 2.3.4.4b, responsable d’épidémies chez les oiseaux et d’infections chez les mammifères et l’homme, souligne l’importance de comprendre les facteurs influençant l’adaptation virale et la susceptibilité de l’hôte.Le système immunitaire inné, première ligne de défense, joue un rôle clé dans l’issue de l’infection. Pourtant, les mécanismes par lesquels les protéines de l’immunité innée détectent, limitent ou sont contournées par les IAVs, et leur rôle dans la barrière d’espèces, restent mal compris.Cette thèse a utilisé des approches approfondies et exploratoires afin d’identifier des facteurs de l’hôte modulant la réplication des IAVs via différentes voies de signalisation. Le facteur de transcription AP-1 cFos a été trouvé comme favorisant la réplication du virus, possiblement en inhibant l’interféron-β, en limitant l’apoptose et en soutenant la transcription virale. Des analyses comparatives ont montré comment l’immunité innée influence la détermination de l’hôte et pourrait aider à évaluer le risque pandémique des IAVs aviaires, malgré des limites méthodologiques actuelles.Globalement, ce travail enrichit notre compréhension des interactions entre l’IAV et l’immunité innée, identifie des facteurs de l’hôte à explorer et ouvre la voie à de meilleurs outils d’évaluation du risque pandémique des IAV aviaires émergents. |



