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In-vivo live imaging in zebrafish larvae: opportunities and challenges.

par Garteizgogeascoa Suñer, Ines
Président du jury Lybaert, Pascale
Promoteur Singh, Sumeet Pal
Publication Non publié, 2024-09-30

Thèse de doctorat

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Résumé :

The phrase “seeing is believing” is particularly important for the scientific community. Observation is a way to both confirm existing beliefs and to open new research avenues and boost scientific progress. Many times, observations defy existing theories. For this, generating new imaging tools and methods has been a hot topic in science since the 17th century. Since then, there have been rapid advances in technology, imaging and analyzing methods that are transforming the way we understand biology and pathology at all levels. In this thesis we explore the opportunities and challenges of in vivo live imaging techniques in zebrafish larvae, a model organism recognized worldwide for its imaging power. We present the first genetically encoded calcium indicator for interstitial calcium that can open new windows for biological discovery and a knock in reporter line that can capture the dynamics of stress adaptation at a whole organism level. However, with this study, we also raise awareness that even if through observation groundbreaking discoveries have been made, there are also risks and artefacts associated with live imaging methods that need to be taken into consideration and carefully evaluated.L’expression « voir, c’est croire » est particulièrement importante pour la communauté scientifique. L’observation est un moyen à la fois de confirmer les croyances existantes, mais aussi d’ouvrir de nouvelles voies de recherche et de dynamiser le progrès scientifique. Bien souvent, les observations défient les théories existantes. Pour cela, la génération de nouveaux outils et méthodes d’imagerie est un sujet scientifique brûlant depuis le XVIIe siècle. Depuis lors, des progrès rapides ont été réalisés dans la technologie, les méthodes d’imagerie et d’analyse qui transforment la façon dont nous comprenons la biologie et la pathologie à tous les niveaux. Dans cette thèse, nous explorons les opportunités et les défis des techniques d’imagerie vivante chez les larves de poisson zèbre, un organisme modèle reconnu mondialement pour son pouvoir d’imagerie. Nous présentons le premier indicateur de calcium génétiquement codé pour le calcium interstitiel qui peut ouvrir de nouvelles avenues pour la découverte biologique et une ligne transgenique rapporteur capable de capturer la dynamique de l'adaptation au stress au niveau de l'organisme entier. Cependant, avec cette étude, nous sensibilisons également au fait que même si des découvertes révolutionnaires ont été réalisées grâce à l’observation, il existe également des risques et des artefacts associés aux méthodes d’imagerie en direct qui doivent être pris en considération et soigneusement évalués.