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Improving Infinium MethylationEPIC data processing: re-annotation of enhancers and long noncoding RNA genes and benchmarking of normalization methods.

par Bizet, Martin ;Defrance, Matthieu ;Calonne, Emilie ;Bontempi, Gianluca ;Sotiriou, Christos ;Fuks, François ;Jeschke, Jana
Référence Epigenetics, 17, 13, page (2434-2454)
Publication Publié, 2022-12-01

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Titre:	Improving Infinium MethylationEPIC data processing: re-annotation of enhancers and long noncoding RNA genes and benchmarking of normalization methods.
Auteur:	Bizet, Martin; Defrance, Matthieu; Calonne, Emilie; Bontempi, Gianluca; Sotiriou, Christos; Fuks, François; Jeschke, Jana
Informations sur la publication:	Epigenetics, 17, 13, page (2434-2454)
Statut de publication:	Publié, 2022-12-01
Sujet CREF:	Sciences bio-médicales et agricoles
Mots-clés:	5mC
	850k
	DNA methylation
	EPIC
	MethylationEPIC
	annotation
	enhancers
	infinium
	long noncoding RNA
	normalization
MeSH keywords:	Humans
	CpG Islands
	DNA Methylation
	RNA, Long Noncoding -- genetics
	Oligonucleotide Array Sequence Analysis -- methods
	Benchmarking
	Reproducibility of Results
Note générale:	SCOPUS: ar.j
Langue:	Anglais
Identificateurs:	urn:issn:1559-2294
	info:doi/10.1080/15592294.2022.2135201
	info:scp/85141499394
	info:pmid/36354000
	PMC9665128