In search of covariates of HIV-1 subtype B spread in the United States—a cautionary tale of large-scale Bayesian phylogeography

Article révisé par les pairs

On the use of phylogeographic inference to infer the dispersal history of rabies virus: A review study
par Nahata, Kanika K.D. , Bollen, Nena , Gill, Mandev M.S. , Layan, Maylis , Bourhy, Hervé , Dellicour, Simon , Baele, Guy
Publication 2021-08
Relax, Keep Walking - A Practical Guide to Continuous Phylogeographic Inference with BEAST
par Dellicour, Simon , Gill, Mandev M.S. , Faria, Nuno Rodrigues , Rambaut, Andrew , Pybus, Oliver George , Suchard, Marc M.A. , Lemey, Philippe
Publication 2021-08
Dispersal dynamics of SARS-CoV-2 lineages during the first epidemic wave in New York City
par Dellicour, Simon , Hong, Samuel S.L. , Vrancken, Bram , Chaillon, Antoine , Gill, Mandev M.S. , Maurano, Matthew M.T. , Ramaswami, Sitharam , Zappile, Paul , Marier, Christian , Harkins, Gordon William , Baele, Guy , Duerr, Ralf , Heguy, Adriana
Publication 2021-05
nosoi: A stochastic agent-based transmission chain simulation framework in R
par Lequime, Sebastian , Bastide, Paul , Dellicour, Simon , Lemey, Philippe , Baele, Guy
Publication 2020-08-01
Mathematical modelling and phylodynamics for the study of dog rabies dynamics and control: A scoping review
par Layan, Maylis , Dellicour, Simon , Baele, Guy , Cauchemez, Simon , Bourhy, Hervé
Publication 2021-05

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