par Coussement, Julien 
Président du jury Melot, Christian
Promoteur Denis, Olivier
Co-Promoteur Pierard, Denis
Publication Non publié, 2019-12-12
Président du jury Melot, Christian
Promoteur Denis, Olivier
Co-Promoteur Pierard, Denis
Publication Non publié, 2019-12-12
Thèse de doctorat
| Résumé : | Dans le domaine des maladies infectieuses, l’épidémiologie clinique utilise les principes de l’épidémiologie pour répondre à des questions cliniques relatives aux infections survenant chez nos patients, constituant ainsi le socle de l’« evidence-based medicine ». L’épidémiologie moléculaire consiste quant à elle à étudier une infection en fonction des caractéristiques moléculaires du pathogène et/ou de l’hôte. Mes collègues et moi- même avons combiné épidémiologies clinique et moléculaire afin de clarifier la pertinence de notre pratique historique de dépistage et traitement de la bactériurie asymptomatique chez les patients transplantés de rein.Plusieurs travaux d’épidémiologie clinique ont été conduits. Dans une enquête de pratique européenne, nous avons constaté que la bactériurie asymptomatique était fréquemment dépistée et traitée par antibiotiques chez les transplantés de rein. Dans une revue systématique et méta-analyse Cochrane, nous n’avons cependant pas identifié de preuves en faveur du traitement antibiotique de la bactériurie asymptomatique chez ces patients. Les preuves disponibles étant peu nombreuses et de faible qualité, nous avons réalisé un essai clinique randomisé multicentrique comparant antibiotiques et abstention thérapeutique chez les transplantés de rein ayant un épisode de bactériurie asymptomatique après les deux premiers mois post-greffe. Dans cet essai, l’antibiothérapie n’a pas réduit significativement l’incidence des infections urinaires symptomatiques. Enfin, dans une étude transversale multicentrique, nous avons observé que la prévalence de la bactériurie asymptomatique était basse chez les transplantés de rein après les deux premiers mois post-greffe (environ 3%). L’ensemble de nos travaux plaide contre une politique systématique de dépistage et traitement de la bactériurie asymptomatique chez les patients transplantés de rein, après les deux premiers mois post-greffe.L’épidémiologie moléculaire a été utilisée afin d’identifier les caractéristiques du pathogène et/ou de l’hôte associés à la pyélonéphrite à Escherichia coli, en comparaison à la bactériurie asymptomatique à E. coli, chez les transplantés de rein. Les épisodes de pyélonéphrite différaient significativement de ceux de bactériurie asymptomatique quant à la prévalence de l’opéron pap, un groupe de gênes permettant la production du P- fimbriae, un des facteurs de virulence d’E. coli les plus étudiés. Notre travail suggère que l’adhésion bactérienne joue un rôle important dans la pathogenèse de la pyélonéphrite de greffe rénale, malgré la présence d’une immunodépression et d’anomalies anatomiques de l’arbre urinaire. Le bénéfice potentiel des thérapies ciblées –vaccination, inhibiteurs de l’adhésion, ...– reste à déterminer chez les transplantés de rein.Les résultats de nos recherches ont des implications directes pour la pratique clinique. Tout d’abord, nous devons concevoir et mettre en place des interventions limitant l’usage d’antibiotiques chez les transplantés de rein ayant un épisode de bactériurie asymptomatique après les deux premiers mois post-greffe. Ces prescriptions d’antibiotiques survenant typiquement en réponse à un résultat positif de culture d’urine demandée systématiquement dans le cadre de la surveillance post-greffe routinière, il semble prioritaire de lutter contre la prescription systématique des cultures d’urines dans le suivi de ces patients. Par ailleurs, il est urgent d’identifier des stratégies innovantes permettant de prévenir les infections urinaires symptomatiques, qui restent un problème fréquent et important chez les transplantés de rein, sans recourir aux antibiotiques. |
| In the field of infectious diseases, clinical epidemiology can be defined as the application of principles of epidemiology to conduct studies that answer clinical questions related to infections; it serves as the basic science of evidence-based medicine. Molecular epidemiology can be defined as the study of an infection in relation to the molecular characteristics of the causative microorganism and/or the host. My colleagues and I combined clinical and molecular epidemiology studies to determine the usefulness of a screen-and-treat strategy for asymptomatic bacteriuria among kidney transplant recipients.Clinical epidemiology was used to directly evaluate the practice of screening for and treating asymptomatic bacteriuria among kidney transplant recipients. In a survey of practice across Europe, we found that asymptomatic bacteriuria was frequently screened for and treated by kidney transplant physicians. However, a Cochrane systematic review and meta-analysis found no evidence to support the routine treatment of asymptomatic bacteriuria in kidney transplant recipients. Because data were scarce and of low-quality, we performed a pragmatic, multicenter randomized trial to compare antibiotic versus no antibiotic therapy in kidney transplant recipients who have asymptomatic bacteriuria beyond the second month post-transplant. In this trial, antibiotics did not significantly reduce the incidence of symptomatic urinary tract infection. Moreover, in a multicenter, cross-sectional study, the prevalence of asymptomatic bacteriuria was lower than expected in kidney transplant recipients. Specifically, only around 3% of screened kidney transplant recipients had asymptomatic bacteriuria beyond two months post-transplant. Taken together, our clinical epidemiology studies do not support the effectiveness of a screen-and-treat strategy for asymptomatic bacteriuria in kidney transplant recipients who are beyond two months post-transplant.Molecular epidemiology was used to identify pathogen and/or host factor(s) associated with the risk of Escherichia coli pyelonephritis, as compared with asymptomatic E. coli bacteriuria, after kidney transplantation. E. coli pyelonephritis episodes differed significantly from asymptomatic E. coli bacteriuria episodes in the prevalence of the pap operon, a gene cluster that encodes the proteins required for production of P fimbriae, one of the best-studied E. coli virulence factors. These findings suggest that bacterial adherence plays a role in the pathogenesis of pyelonephritis in kidney transplant recipients despite significantly altered host urinary tract anatomy and weakened immunity. Whether kidney transplant recipients might benefit from targeted therapies (e.g., vaccination or inhibitors of fimbrial adhesion) has yet to be studied.Our findings have direct implications. It is now time to design and implement antimicrobial stewardship interventions to limit unwarranted antimicrobial use in kidney transplant recipients who have asymptomatic bacteriuria beyond two months post-transplant. Because antibiotic prescribing for asymptomatic bacteriuria typically occurs in response to the positive result from a urine culture requested during routine screening for bacteriuria in post-transplant follow-up, a priority should be to reduce systematic urine culture in these patients. It is also important that innovative non-antibiotic-based approaches should be developed to prevent symptomatic urinary tract infections, which remain prevalent and detrimental after kidney transplantation. |
