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Pan-genome multilocus sequence typing and outbreak-specific reference-based SNP analysis to resolve two concurrent Staphylococcus aureus outbreaks in neonatal services.

par Roisin, Sandrine ;Gaudin, Cyril;De Mendonça, Ricardo ;Bellon, J;Van Vaerenbergh, Kristien;De Bruyne, Katrien;Byl, Baudouin ;Pouseele, Hannes;Denis, Olivier ;Supply, Philip
Référence Clinical microbiology and infection, 22, 6, page (520-526)
Publication Publié, 2016-02

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Titre:	Pan-genome multilocus sequence typing and outbreak-specific reference-based SNP analysis to resolve two concurrent Staphylococcus aureus outbreaks in neonatal services.
Auteur:	Roisin, Sandrine; Gaudin, Cyril; De Mendonça, Ricardo; Bellon, J; Van Vaerenbergh, Kristien; De Bruyne, Katrien; Byl, Baudouin; Pouseele, Hannes; Denis, Olivier; Supply, Philip
Informations sur la publication:	Clinical microbiology and infection, 22, 6, page (520-526)
Statut de publication:	Publié, 2016-02
Sujet CREF:	Sciences bio-médicales et agricoles
Mots-clés:	Staphylococcus aureus
	de novo assembly
	multilocus sequence typing
	neonatal
	nosocomial outbreaks
	pan-genome
	single nucleotide polymorphism
	spa-typing
	whole genome sequencing
Langue:	Anglais
Identificateurs:	urn:issn:1198-743X
	info:doi/10.1016/j.cmi.2016.01.024
	info:pii/S1198-743X(16)00104-X
	info:scp/84962209354
	info:pmid/26899827