Parties d'ouvrages collectifs (1)
Articles dans des revues avec comité de lecture (66)
2.
Jain, S., Trinidad, M., Nguyen, T. B., Jones, K., Neto, S. D., Ge, F., Glagovsky, A., Jones, C., Moran, G., Wang, B., Rahimi, K., Çalıcı, S. Z., Cedillo, L., Berardelli, S., Özden, B., Chen, K., Katsonis, P., Williams, A., Lichtarge, O., Rana, S., Pradhan, S., Srinivasan, R., Sajeed, R., Joshi, D., Faraggi, E., Jernigan, R., Kloczkowski, A., Xu, J., Song, Z., Özkan, S., Padilla, N., de la Cruz, X., Acuna-Hidalgo, R., Grafmüller, A., Barrón, L. T. J., Manfredi, M., Savojardo, C., Babbi, G., Martelli, P. L., Casadio, R. R., Sun, Y., Zhu, S., Shen, Y., Pucci, F., Rooman, M., Cia, G., Raimondi, D., Hermans, P., Kwee, S., Chen, E., Astore, C., Kamandula, A., Pejaver, V., Ramola, R., Velyunskiy, M., Zeiberg, D., Mishra, R., Sterling, T., Goldstein, J. L., Lugo-Martinez, J., Kazi, S., Li, S., Long, K., Brenner, S. E., Bakolitsa, C., Radivojac, P., Suhr, D., Suhr, T., & Clark, W. T. (2025). Evaluation of enzyme activity predictions for variants of unknown significance in Arylsulfatase A. Human genetics, 144(2-3), 295-308. doi:10.1007/s00439-025-02731-33.
Rastogi, R., Chung, R., Li, S., Li, C., Lee, K., Woo, J., Kim, D. W., Keum, C., Babbi, G., Martelli, P. L., Savojardo, C., Casadio, R. R., Chennen, K., Weber, T. S., Poch, O., Ancien, F., Camperio Ciani, G., Pucci, F., Raimondi, D., Vranken, W., Rooman, M., Marquet, C., Olenyi, T., Rost, B., Andreoletti, G., Kamandula, A., Peng, Y., Bakolitsa, C., Mort, M., Cooper, D. N., Bergquist, T., Pejaver, V., Liu, X., Radivojac, P., Brenner, S. E., & Ioannidis, N. M. (2025). Critical assessment of missense variant effect predictors on disease-relevant variant data. Human genetics, 144(2-3), 281-293. doi:10.1007/s00439-025-02732-25.
Bu, F., Adam, Y., Adamiak, R., Antczak, M., de Aquino, B. R., Badepally, N. G., Batey, R., Baulin, E., Boinski, P., Boniecki, M., Bujnicki, J. M., Carpenter, K. L., Chacon, J., Chen, S.-J., Chiu, W., Cordero, P., Das, N. K., Das, R., Dawson, W., DiMaio, F., Ding, F., Dock-Bregeon, A.-C., Dokholyan, N., Dror, R., Dunin-Horkawicz, S., Eismann, S., Ennifar, E., Esmaeeli, R., Farsani, M. A., Ferré-D’Amaré, A., Geniesse, C., Ghanim, G., Guzman, H. V., Hood, I., Huang, L., Jain, D. S., Jaryani, F., Jin, L., Joshi, A., Karelina, M., Kieft, J., Kladwang, W., Kmiecik, S., Koirala, D., Kollmann, M., Kretsch, R., Kurciński, M., Li, J., Li, S., Magnus, M., Masquida, B., Moafinejad, N., Mondal, A., Mukherjee, S., Nguyen, T. H. D., Nikolaev, G., Nithin, C., Nye, G., Pandaranadar Jeyeram, I., Perez, A., Pham, P., Piccirilli, J. A., Pilla, S. P., Pluta, R., Poblete, S., Ponce-Salvatierra, A., Popenda, M., Popenda, L., Pucci, F., Rangan, R., Ray, A., Ren, A., Sarzynska, J., Sha, C. M., Stefaniak, F., Su, Z., Suddala, K., Szachniuk, M., Townshend, R., Trachman, R., Wang, J., Wang, W., Watkins, A., Wirecki, T., Xiao, Y., Xiong, P., Xiong, Y., Yang, J., Yesselman, J. D., Zhang, J., Zhang, Y., Zhang, Z., Zhou, Y., Zok, T., Zhang, D., Zhang, S., Żyła, A., Westhof, E., & Miao, Z. (2025). RNA-Puzzles Round V: blind predictions of 23 RNA structures. Nature methods, 22(2), 399-411. doi:10.1038/s41592-024-02543-96.
Turina, M. P., Petrosino, M., Enriquez Sandoval, C., Novak, L., Pasquo, A., Alexov, E., Alladin, M. A., Ascher, D., Babbi, G., Bakolitsa, C., Casadio, R. R., Cheng, J., Fariselli, P., Folkman, L., Kamandula, A., Katsonis, P., Li, M., Li, D., Lichtarge, O., Mahmud, S., Martelli, P. L., Pal, D., Panday, S. K., Pires, D. E. V., Portelli, S., Pucci, F., Rodrigues, C. H. M., Rooman, M., Savojardo, C., Schwersensky, M., Shen, Y., Strokach, A. V., Sun, Y., Woo, J., Radivojac, P., Brenner, S. E., Chiaraluce, R., Consalvi, V., & Capriotti, E. (2025). Assessing the predicted impact of single amino acid substitutions in MAPK proteins for CAGI6 challenges. Human genetics. doi:10.1007/s00439-024-02724-87.
Hermans, P., Tsishyn, M., Schwersensky, M., Rooman, M., & Pucci, F. (2025). Exploring Evolution to Uncover Insights Into Protein Mutational Stability. Molecular biology and evolution, 42(1). doi:10.1093/molbev/msae2678.
Benaroua, C., Pucci, F., Rooman, M., Picod, A., Favory, R., Legrand, M., Vincent, J. L., Creteur, J., Taccone, F., Annoni, F., & Garcia, B. (2025). Alterations in the renin-angiotensin system during septic shock. Annals of intensive care, 15(1). doi:10.1186/s13613-025-01463-x9.
Turina, M. P., Dal Cortivo, G., Enriquez Sandoval, C. A., Alexov, E., Ascher, D. B., Babbi, G., Bakolitsa, C., Casadio, R. R., Fariselli, P., Folkman, L., Kamandula, A., Katsonis, P., Li, D., Lichtarge, O., Martelli, P. L., Panday, S. K., Pires, D. E. V., Portelli, S., Pucci, F., Rodrigues, C. H. M., Rooman, M., Savojardo, C., Schwersensky, M., Shen, Y., Strokach, A. V., Sun, Y., Woo, J., Radivojac, P., Brenner, S. E., Dell’Orco, D., & Capriotti, E. (2024). Assessing the predicted impact of single amino acid substitutions in calmodulin for CAGI6 challenges. Human genetics. doi:10.1007/s00439-024-02720-y10.
Zhang, J., Kinch, L., Katsonis, P., Lichtarge, O., Jagota, M., Song, Y. S., Sun, Y., Shen, Y., Kuru, N., Dereli, O., Adebali, O., Alladin, M. A., Pal, D., Capriotti, E., Turina, M. P., Savojardo, C., Martelli, P. L., Babbi, G., Casadio, R. R., Pucci, F., Rooman, M., Cia Beriain, G., Tsishyn, M., Strokach, A., Hu, Z., van Loggerenberg, W., Roth, F. P., Radivojac, P., Brenner, S. E., Cong, Q., & Grishin, N. (2024). Assessing predictions on fitness effects of missense variants in HMBS in CAGI6. Human genetics. doi:10.1007/s00439-024-02680-3